Οι παθήσεις βυθού αφορούν στο οπίσθιο τμήμα του οφθαλμού. Η εκφύλιση της ωχράς κηλίδας, η διαβητική αμφιβληστροειδοπάθεια, οι αποφράξεις φλέβας ή αρτηρίας αμφιβληστροειδούς, η αποκόλληση του αμφιβληστροειδούς αποτελούν  παθήσεις που απειλούν την όραση του ασθενούς. Και σε αυτές τις περιπτώσεις η έγκαιρη διάγνωση με την βυθοσκόπηση και το OCT καθορίζουν την θεραπεία και βελτιώνουν την πρόγνωση του ασθενούς.